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曙光中標(biāo)深圳基因組所,，助力打通農(nóng)業(yè)產(chǎn)業(yè)“創(chuàng)新鏈條”

發(fā)布時(shí)間: 2021-06-21


農(nóng)業(yè)基因組學(xué)是當(dāng)代農(nóng)業(yè)科技創(chuàng)新的核心引擎，也是帶動(dòng)我國(guó)農(nóng)業(yè)高速發(fā)展的“復(fù)興號(hào)列車”,。

近日,，曙光攜手中國(guó)農(nóng)業(yè)科學(xué)院(深圳)農(nóng)業(yè)基因組研究所（以下簡(jiǎn)稱“基因組所”），助力搭建基因數(shù)大數(shù)據(jù)計(jì)算平臺(tái)存儲(chǔ)項(xiàng)目,。其中,，利用生物組學(xué)大數(shù)據(jù)推動(dòng)生物育種變革，打造了貫穿“種質(zhì)資源收集-基因組測(cè)序與分析-功能基因挖掘-分子設(shè)計(jì)育種-品種推廣”全產(chǎn)業(yè)的創(chuàng)新鏈條,。

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用信息技術(shù)打通產(chǎn)業(yè)創(chuàng)新鏈條

基因組所是國(guó)內(nèi)唯一一家專門從事農(nóng)業(yè)基因組學(xué)研究的國(guó)家級(jí)研究所,，主要從事農(nóng)業(yè)基因組學(xué)、農(nóng)業(yè)動(dòng)植物分子育種等領(lǐng)域的科學(xué)研究,，致力于推動(dòng)生命科學(xué)前沿學(xué)科與農(nóng)業(yè),、食品與健康、生態(tài)與環(huán)境等三大領(lǐng)域的交叉融合,，加速生命前沿技術(shù)在農(nóng)業(yè)和社會(huì)經(jīng)濟(jì)發(fā)展中的應(yīng)用,。

如今，生物信息學(xué)正扮演著越來越重要的角色,，在信息時(shí)代給基因組學(xué)巨大的推動(dòng)力,。基因組學(xué)領(lǐng)域產(chǎn)生了海量數(shù)據(jù),，如何通過農(nóng)業(yè)生物信息學(xué)與計(jì)算科學(xué)挖掘出更大價(jià)值,，成為基因組所業(yè)務(wù)發(fā)展的關(guān)鍵環(huán)節(jié)。

該大數(shù)據(jù)計(jì)算平臺(tái)計(jì)算能力400Tflops,， 存儲(chǔ)能力10PB,，計(jì)算分區(qū)和存儲(chǔ)分區(qū)網(wǎng)絡(luò)采用100Gb/s Infiniband EDR高速互聯(lián)，高速互聯(lián)網(wǎng)絡(luò)的搭建為存儲(chǔ)提供高達(dá)80Gb/s的聚合帶寬,，為實(shí)現(xiàn)生物大數(shù)據(jù)的深度挖掘奠定基礎(chǔ),。其中存儲(chǔ)資源分區(qū)采用曙光ParaStor分布式存儲(chǔ)系統(tǒng)，可以為基因數(shù)據(jù)庫(kù)等提供海量存儲(chǔ)空間,。

通過高效,、安全的基因數(shù)據(jù)庫(kù)，可有效利用基因組學(xué)、蛋白組學(xué),、代謝組學(xué)等技術(shù)手段,，實(shí)現(xiàn)高品質(zhì)精準(zhǔn)功能育種；重點(diǎn)突破人類基因組學(xué),、營(yíng)養(yǎng)代謝組學(xué)等生物組學(xué)技術(shù)難題,，創(chuàng)制營(yíng)養(yǎng)靶向設(shè)計(jì)、健康個(gè)性訂制的新型營(yíng)養(yǎng)健康食品,。

為“生物信息”提供高可靠平臺(tái)

隨著多組學(xué)數(shù)據(jù)額激增,，數(shù)據(jù)挖掘的難度不斷加大。作為底層的存儲(chǔ)系統(tǒng),，既要滿足海量基因數(shù)據(jù)激增帶來的擴(kuò)展性需求,，又要滿足帶寬及IOPS需求。

中科曙光憑借多年在生物基因領(lǐng)域積累的經(jīng)驗(yàn),，打造了完善的生物基因行業(yè)云存儲(chǔ)解決方案,。通過Scale-Out橫向擴(kuò)展、IB+RDMA高速互聯(lián),、內(nèi)核態(tài)POSIX協(xié)議,、智能SSD Cache及小文件聚合等技術(shù)，消除傳統(tǒng)的Scale-up縱向擴(kuò)展存儲(chǔ)架構(gòu)的性能局限性,，解決生物基因應(yīng)用中對(duì)海量大文件存儲(chǔ)場(chǎng)景高聚合帶寬,、小文件存儲(chǔ)場(chǎng)景高IOPS的存儲(chǔ)需求。

其次,，基因研究產(chǎn)生的數(shù)據(jù)正以每12-18個(gè)月10倍的速度快速增長(zhǎng),，曙光ParaStor分布式存儲(chǔ)系統(tǒng)可通過性能與容量的線性增長(zhǎng)，滿足存儲(chǔ)系統(tǒng)對(duì)數(shù)據(jù)處理能力和擴(kuò)展性的要求,，并通過多種技術(shù)手段,，從物理底層到邏輯層全方位保證存儲(chǔ)系統(tǒng)高可靠性和高可用性，滿足前端多種基因測(cè)序軟件,、多種業(yè)務(wù)應(yīng)用的存儲(chǔ)對(duì)接需求,。

基因組、蛋白組,、代謝組等生物組學(xué)、基因編輯,、合成生物學(xué)等一系列學(xué)科發(fā)展和技術(shù)創(chuàng)新,，推動(dòng)著農(nóng)業(yè)生物技術(shù)以前所未有的速度向前發(fā)展。曙光不斷將最先進(jìn)的信息技術(shù)與生物信息學(xué)進(jìn)行融合,。將自身的存儲(chǔ)產(chǎn)品與第二代基因測(cè)序和三代測(cè)序,、主流應(yīng)用軟件長(zhǎng)期對(duì)接測(cè)試與優(yōu)化是曙光扎根于該領(lǐng)域的基礎(chǔ)。對(duì)于生物信息復(fù)雜應(yīng)用軟件的完美適配以及均衡穩(wěn)定的性能表現(xiàn),，讓曙光在生物基因領(lǐng)域得到了廣泛的認(rèn)可,。


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